t载体怎么用

1.T载体如何制备

用限制性内切酶制备T载体 陆哲明,柯 杨△[北京大学临床肿瘤学院(北京市肿瘤防治研究所)遗传室,北京 100034] [关键词]T载体;DNA限制酶类;遗传载体;基因扩增[摘 要] 目的:介绍一种制备T载体的方法。

方法:用限制性内切酶XcmⅠ酶切,在两端产生T末端,制备的T载体可直接用来克隆用TaqDNA聚合酶产生带A末端的PCR产物。结果:PCR产物直接和T载体连接,用常规氯化钙法制备的感受态菌转化,对转化子提取质粒进行酶切鉴定,证明阳性率达80%。

结论:制备T载体过程简单,质量稳定,产量高,并可扩增等优点。[中图分类号]Q342 [文献标识码]A [文章编号]1671 167X(2002)06 0726 03 PCR是目前体外DNA扩增最常用的方法,对PCR产物进行快速有效的克隆是开展下游许多实验所要求的。

目前TA克隆是一种快速的,一步到位地把PCR产物直接插入到质粒载体的方法。而商品化的TA克隆系统由于售价高,质量批次间不稳定且无法进行循环使用等缺点,在实际应用中,限制了T载体的广泛使用。

本文介绍了一种简单、高效,可在普通实验室中制备并可反复扩增的T载体制备方法,并经PCR产物克隆,酶切鉴定,得到了非常理想的结果。1 材料与方法1.1 制备SuperpGEM Teasy载体(简称pSP Teasy载体)1.1.1 制备pSP Teasy环化载体 以线性化的pGEM Teasy载体(Promega为模板,两边设计引物:F: HindⅢ XcmⅠG AATTCGCG R: HindⅢ XcmⅠC CGCGGCCGCCA 引物的5′端各插入HindⅢ和XcmⅠ位点,3′端与模板互补,在PfuDNA聚合酶的作用下扩增,扩增产物经HindⅢ酶切后,自身环化,挑选能被HindⅢ酶切的克隆即为阳性克隆,经测序进一步证实。

1.1.2 制备pSP Teasy线性化载体 按照标准酶切体系,用XcmⅠ(NEB)酶切,酶切产物经琼脂糖凝胶电泳后,玻璃奶回收,测量吸光度值(D260),调整质量浓度至50mg·L-1,此载体可直接用于克隆。3 讨论PCR技术是目前体外扩增DNA最常用的方法。

有时需得到克隆化的DNA以便于杂交分析、高质量测序及从复杂PCR产物中分离目的片段。常用的方法有非定向克隆和定向克隆。

定向克隆需在引物5′端引入限制性内切酶位点,PCR产物经适当内切酶酶切后产生粘端,连接到相应载体。非定向克隆有两种策略,一种是平末端克隆,在klenow和T4DNA聚合酶作用下修平PCR产物末端,但连接效率仅为粘端连接的1/50,且自身环化率高[1];另一种是TA克隆。

TA克隆是一种快速的,一步到位的非定向克隆法,可以把PCR产物直接插入到质粒载体。TA克隆系统利用TaqDNA聚合酶的末端转移酶活性,在扩增DNA3′末端非模板依赖地加上一个核苷酸,通常为腺苷酸[2]。

这个3′A突出端被用于把PCR产物插入到插入位点有一个3′T突出端的载体。制备好的载体,其关键部分是带有3′T突出端的线性分子。

目前制备3′T载体的方法是先用平末端限制性内切酶(如EcoRⅤ)酶切载体,再用TaqDNA聚合酶在仅有dTTP的情况下,72~75℃反应,在3′末端添加一个T[1,3]。但是,实际反应过程中,由于3′末端加T为非优先聚合核苷酸,仅部分的3′端可添加T,或者有少量可能添加一个以上T,造成载体在克隆过程中自身环化高,必然增加筛选阳性克隆的难度。

另外,每次生产T载体产量有限(一般为1μg),不适于大规模生产,造成批次间质量差异大。即使商品化TA克隆试剂盒也存在阳性率低和质量不稳定的缺点。

因其价格昂贵,并且无法进行循环使用,在普及上存在一定困难。利用限制性内切酶制备T载体利用限制性内切酶特异性强,一次酶切产量高,质量稳定,易于操作等特点。

在内切酶家族中,有一类称可变酶,它们的识别序列中的一个或几个核苷酸是可变的,如本文采用的XcmⅠ,它识别序列见图3a,在构建pSP Teasy载体时,利用其中间序列可变,在靠近T7启动子端,设计了XcmⅠ的识别序列见图3b,而在靠近SP6启动子端XcmⅠ的识别序列见图3c,这样在XcmⅠ酶切后,其剩余的序列如图1,在3′端分别产生T。经查NewEnglandBiolabs公司的目录,符合上述特征的酶列于表1。

我们在两个XcmⅠ之间引入HindⅢ位点有下列优点:(1)在构建pSP Teasy时提供方便;(2)经HindⅢ酶切后,可以防止载体中的XcmⅠ位点不完全酶切造成的自身环化;(3)两个XcmⅠ位点之间,提供保护的碱基,便于XcmⅠ酶切。用于克隆的PCR产物在连接前需经琼脂糖凝胶电泳,如条带锐利,则一般无需纯化即可直接用于连接;如产物有非特异扩增或引物二聚体浓度较高,最好先用低熔点胶或玻璃奶法纯化。

如果扩增用具有保真功能的聚合酶,如PfuDNA聚合酶、PwoDNA聚合酶或TliDNA聚合酶,由于它们有3′~5′的外切酶活性,则PCR产物为平末端,需经纯化后用TaqDNA聚合酶在dATP存在下72℃加腺苷酸尾15~30min,即可达到相同效果。插入片段(PCR产物)与载体摩尔比一般要求在3∶1~1∶3之间,但按笔者经验,摩尔比不经优化亦可产生较好克隆效果,可能与pSP 。

2.什么是T载体

T载体又称T-vector。聚合酶链反应产物的克隆运载体,线性化后两侧3′端各多出一个脱氧胸苷酸(T)。由于PCR产物两侧3′端通常含单个脱氧腺苷酸(A),与T载体之间的A-T互补性可提高PCR产物克隆的效率。

T载体是一种克隆载体,也就是用于在受体细胞中进行目的基因扩增的载体,它不能大量表达。多用于克隆PCR产物,一般用一些常见的载体改造成的,一般的DNA聚合酶没有3'-5'核酸外切酶活性,即酶的校正活性,在PCR产物3'末端以非模板依靠方式加上一个腺苷酸残基(A),这样PCR产物的3'腺苷酸可和T-载体的3'胸腺嘧啶 互补,T-载体系统进行有效连接的基础正是这种碱基配对作用。相反,有校正活性的聚合酶将移去这个3' 突出端,产生平端PCR产物,这种产物不能直接用T-载体系统进行克隆。

假如想要一PCR扩增基因的产物大量表达,常见的方法是先将PCR产物连入T载体扩增(所用T载体需事先设计好酶切位点),再用相应酶切下目的片段,然后连入以同样酶切处理后的表达载体大量表达蛋白质。

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